Corso di laurea magistrale Interateneo in Fisica dei sistemi complessi

L'insegnamento offre un'introduzione alla Biologia Computazionale, con particolare attenzione all'utilizzo delle tecniche più importanti di meccanica statistica e di fisica teorica per lo studio dei sistemi biologici.

Conoscenza e capacità di comprensione:

Alla fine dell'insegnamento gli studenti e le studentesse avranno una conoscenza approfondita dei più moderni risultati nel campo della Biologia Computazionale, delle tecniche di inferenza in Biologia Molecolare e dei più moderni metodi di simulazione applicati ai sistemi biologici.

Capacità di applicare conoscenza e comprensione:

Al termine dell'insegnamento gli studenti e le studentesse dovranno essere in grado di risolvere alcuni semplici esempi di regolazione genica, e discutere proprietà di teoria delle reti e della statistica Bayesiana

Si discuteranno alcune applicazioni della meccanica statistica ai sistemi
biologici. In particolare:
  - Entropia di Shannon e sue generalizzazioni per l'analisi di sequenze
  - Catene di Markov nascoste e data mining
  - Simulazione al calcolatore di sistemi biologici:
     Metodi Montecarlo e Dinamica Molecolare
  - Teoria dei network
  - Dinamica dei circuiti di regolazione genica

Lezione frontale, se necessario con uso di slide.

L'esame è costituito da una prova orale, della durata tipica di 40-50 minuti, nella quale viene chiesto di affrontare ab initio due, o al più tre, argomenti svolti a lezione,  discutendo sia gli aspetti  fisici che biologici del problema . In caso di non superamento dell'esame la ripetizione dello stesso deve avvenire almeno due settimane dopo la prima prova.

La modalità di verifica dell'apprendimento rimane invariata anche nel caso avvenga per via telematica, attraverso videoconferenza.

A partire da Settembre 2020 gli esami si terranno di nuovo in presenza.  Sarà pssibile comunque chiedere di sostenere l'esame per via telematica.  Chi fosse interessato a questa opzione è pregato di contattarmi

L'insegnamento inizierà lunedì 2 Ottobre 2023