Corso di laurea magistrale Interateneo in Fisica dei sistemi complessi

L'insegnamento offre un'introduzione alla Biologia Computazionale, con particolare attenzione all'utilizzo delle tecniche più importanti di meccanica statistica e di fisica teorica per lo studio dei sistemi biologici.

Conoscenza e capacità di comprensione:

Alla fine dell'insegnamento gli studenti e le studentesse avranno una conoscenza approfondita dei più moderni risultati nel campo della Biologia Computazionale, delle tecniche di inferenza in Biologia Molecolare e dei più moderni metodi di simulazione applicati ai sistemi biologici.

Capacità di applicare conoscenza e comprensione:

Al termine dell'insegnamento gli studenti e le studentesse dovranno essere in grado di risolvere alcuni semplici esempi di regolazione genica, e discutere proprietà di teoria delle reti e della statistica Bayesiana

Si discuteranno alcune applicazioni della meccanica statistica ai sistemi
biologici. In particolare:
  - Entropia di Shannon e sue generalizzazioni per l'analisi di sequenze
  - Catene di Markov nascoste e data mining
  - Simulazione al calcolatore di sistemi biologici:
     Metodi Montecarlo e Dinamica Molecolare
  - Teoria dei network
  - Dinamica dei circuiti di regolazione genica

Lezione frontale, se necessario con uso di slide.

L'esame è costituito da una prova orale, della durata tipica di 40-50 minuti, nella quale viene chiesto di affrontare ab initio due, o al più tre, argomenti svolti a lezione,  discutendo sia gli aspetti  fisici che biologici del problema . In caso di non superamento dell'esame la ripetizione dello stesso deve avvenire almeno due settimane dopo la prima prova.

L'insegnamento inizierà lunedì 23 Settembre 2024