- Oggetto:
- Oggetto:
Sistemi complessi per la biologia
- Oggetto:
Complex Systems for Biology
- Oggetto:
Anno accademico 2017/2018
- Codice dell'attività didattica
- INT0381
- Docenti
- Prof. Michele Caselle (Titolare del corso)
Dott. Marco Regis (Titolare del corso) - Corso di studi
- Laurea Magistrale Interateneo in Fisica dei sistemi complessi
- Anno
- 2° anno
- Periodo didattico
- Primo periodo didattico
- Tipologia
- C=Affine o integrativo
- Crediti/Valenza
- 6
- SSD dell'attività didattica
- FIS/02 - fisica teorica, modelli e metodi matematici
- Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- Facoltativa
- Tipologia d'esame
- Orale
- Prerequisiti
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- Propedeutico a
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- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Il corso offre un'introduzione alla Biologia Computazionale, con particolare attenzione all'utilizzo delle tecniche più importanti di meccanica statistica e di fisica teorica per lo studio dei sistemi biologici.
The course offers a general introduction to Computational Biology, with a particular attention to the use and application of tools typical of Statistical Mechanics and Theoretical Physics to Systems Biology.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Alla fine del corso lo studente avrà una conoscenza approfondita dei più moderni risultati nel campo della Biologia Computazionale, delle tecniche di inferenza in Biologia Molecolare e dei più moderni metodi di simulazione applicati ai sistemi biologici.
At the end of course the student will reach a good knowledge of the most advanced results in Computational Biology, of inference methods in Molecular Biology and of the most advanced simulation techniques for Systems Biology.
- Oggetto:
Modalità di insegnamento
Lezione frontale, se necessario con uso di slide
Blackboard lectures. When needed with slides.- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
L'esame è costituito da una prova orale, della durata tipica di 40-50 minuti, nella quale viene chiesto di affrontare ab initio due, o al più tre, argomenti svolti a lezione, discutendo sia gli aspetti fisici che biologici del problema . In caso di non superamento dell'esame la ripetizione dello stesso deve avvenire almeno due settimane dopo la prima prova.
The exam consists in an oral examination, of typical duration of 40-50 minutes, during which the student has to develop ab initio two of the topics explained during the lectures. The student has to demonstrate to have gained both physical insight and technical mathematical abilities. In case the exam fails, it cannot be repeated earlier than two weeks after the first attempt.
- Oggetto:
Attività di supporto
- Oggetto:
Programma
Si discuteranno alcune applicazioni della meccanica statistica ai sistemi
biologici. In particolare:
- Entropia di Shannon e sue generalizzazioni per l'analisi di sequenze
- Catene di Markov nascoste e data mining
- Simulazione al calcolatore di sistemi biologici:
Metodi Montecarlo e Dinamica Molecolare
- Teoria dei network
- Dinamica dei circuiti di regolazione genicaWe shall discuss a few applications of modern statistical mechanics to
biological systems. In particular:
- Shannon entropy and sequence analysis
- Hidden Markov models and data mining
- Computer simulations of biological systems: Montecarlo and Molecular Dynamics.
- Network theory
- Biological circuits in Gene regulationTesti consigliati e bibliografia
- Oggetto:
U. Alon "Introduction to Systems Biology" Chapman & Hall (2007)
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Orario lezioni
Giorni Ore Aula Martedì 11:00 - 13:00 Aula D Dipartimento di Fisica Mercoledì 16:00 - 18:00 Aula D Dipartimento di Fisica Giovedì 16:00 - 18:00 Aula D Dipartimento di Fisica Lezioni: dal 03/10/2017 al 25/11/2017
Nota: Inizio lezioni 3 ottobre
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Note
Il Corso inizierà martedì 3 ottobre 2017
The lectures will start on tuesday, 3/10/2017
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