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Oggetto:
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Sistemi complessi per la biologia

Oggetto:

Complex Systems for Biology

Oggetto:

Anno accademico 2013/2014

Codice dell'attività didattica
INT0381
Docente
Prof. Michele Caselle (Titolare del corso)
Corso di studi
Laurea Magistrale Interateneo in Fisica dei sistemi complessi
Anno
2° anno
Periodo didattico
Primo periodo didattico
Tipologia
C=Affine o integrativo
Crediti/Valenza
6
SSD dell'attività didattica
FIS/02 - fisica teorica, modelli e metodi matematici
Modalità di erogazione
Tradizionale
Lingua di insegnamento
Italiano
Modalità di frequenza
Facoltativa
Tipologia d'esame
Orale
Prerequisiti
Nessuno
Oggetto:

Sommario insegnamento

Oggetto:

Obiettivi formativi

Una solida preparazione sui meccanismi che regolano i sistemi biologici e la loro interazione con
agenti fisici, in particolare con le radiazioni ionizzanti e non ionizzanti, a livello cellulare e
sistemico e in generale allo studio dei problemi tipici della biologia molecolare e delle diverse
metodologie d'indagine. Acquisira’ inoltre competenze nelle applicazioni della fisica alle tecnologie
usate nella terapia e nell'indagine diagnostica in medicina.

Acquisizione delle conoscenze e delle tecniche più importanti di meccanica statistica e di fisica teorica per lo studio dei sistemi biologici.

Oggetto:

Risultati dell'apprendimento attesi

Comprensione della sinergia e dialettica fra sviluppi teorici e progressi sperimentali nella
formulazione, verifica ed applicazione di modellizzazioni di sistemi fisici; capacita' di scelta degli
strumenti matematici ed informatici piu’ opportuni nella risoluzione di problemi complessi.

Conoscenza delle applicazioni della fisica alle tecnologie usate nella terapia e nell'indagine
diagnostica in medicina.


Oggetto:

Programma

Si discuteranno alcune applicazioni della meccanica statistica ai sistemi
biologici. In particolare:
  - Entropia di Shannon e sue generalizzazioni per l'analisi di sequenze
  - Catene di Markov nascoste e data mining
  - Simulazione al calcolatore di sistemi biologici:
     Metodi Montecarlo e Dinamica Molecolare
  - Teoria dei network
  - Dinamica dei circuiti di regolazione genica

We shall discuss a few applications of modern statistical mechanics to
biological systems. In particular:
   - Shannon entropy and sequence analysis
   - Hidden Markov models and data mining
   - Computer simulations of biological systems: Montecarlo and Molecular Dynamics.
   - Network theory
   - Biological circuits in Gene regulation

Testi consigliati e bibliografia

Oggetto:

U. Alon "Introduction to Systems Biology" Chapman & Hall (2007)



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Ultimo aggiornamento: 01/08/2014 09:16
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